TEMEL VETERİNER GENETİK

İn vitro: Canlılarla ilgili biyokimyasal işlemlerin canlı üzerinde değil de yapay ortamda, örneğin petri kabında, deney tüplerinde yapılması.

Jel elektroforezinde, katı alan oluşturmak amacıyla çok farklı kimyasallar kullanılmakla birlikte sıklıkla akrilamid ve kırmızı algden üretilen agaroz tercih edilmektedir.

Tekli nükleotit polimorfizmi (TNP; single nucleotide polymorphism, SNP): Genom üzerinde belirli bölgelerde bireyler arasındaki tek bazlık farklılığa dayanan (A,T, G ya da C) polimorfizm türüdür.

Prob: 20-100 nükleotid uzunluğundaki DNA parçalarıdır. Genellikle floresan boyalarla işaretlenerek bir reaksiyonun oluşumunu kontrol için kullanılırlar. Doğru cevap A'dır.

Piperidin: Proteinlerin yıkımlanması sonucu oluşan amin bileşiğidir ve DNA’da kırılmalara yol açar.

Elektroforezde en hızlı giden band en küçük DNA fragmentidir ve hangi ddNTP ile oluşturulmuş ise primerden sonra gelen ilk baz odur.

Koyunlarda et kalitesi ile ilgili bir diğer QTL de arka bacaklar ve sağrı bölgesindeki kaslarda kas yapısında değişikliğe yol açarak daha fazla et verimine sebep olan Callipyge genidir. Doğru cevap A'dır.

rDNA birçok yöntemle oluşturulabilmektedir ancak genel olarak aşağıdaki sıra takip edilir:
• Hedef DNA parçasının verici organizmadan elde edilmesi,
• Hedef DNA’nın restriksiyon enzimleriyle kesilmesi,
• Kesilen parçanın farklı bir organizmanın DNA’sı ile birleştirilmesi,
• Oluşan yeni DNA’nın direk olarak ya da vektör aracılığıyla bakteri gibi bir konak hücreye aktarılması

Biyomedikal: Tıpta tanı ve tedavi amacıyla araç ve gereçlerin üretimi, tasarımı ve iletişimi ile ilgilenen mühendislik dalıdır.

İn-vitro: Canlılarla ilgili biyokimyasal işlemlerin canlı üzerinde değil de yapay ortamda, örneğin petri kabında, deney tüplerinde yapılması.

Komplementer dizi: Bir DNA iplikçiğinin bazları karşısına hidrojen bağları kurularak sentezlenen ya da eklenen özgül dizidir.

Oligonükleotit: Kısa bir polinükleotit zinciri oluşturmak için bir araya gelmiş birkaç nükleotitten oluşan DNA dizisi.

Amerikalı Biyokimyacı Karry Banks Mullis tarafından 1983’de Polimeraz Zincir Reaksiyonunun (Polymerase Chain Reaction, PCR/PZR) tanımlanması ve çalışmanın 1987 yılında yayınlanmasının ardından moleküler tekniklere her geçen gün yeni bir teknik eklenmiştir.

PCR tüm bir genom yerine, sadece genom üzerinde seçilen bir DNA bölgesinin çoğaltılmasını sağlamaktadır. Bu işleme yükseltgenme denilmektedir.

PCR’ın ilk aşamasında kalıp DNA’nın birkaç dakika süresince 90 ° C’de tutularak zincirlerin birbirinden ayrılması gerekmektedir. Bu işlem karşılıklı zincirler arasındaki hidrojen bağlarının kırılmasını sağlamaktadır ve denatürasyon adı verilmektedir.

Tek zincirli hale getirme işleminin ardından sıcaklık 50-60 ° C civarına düşürülerek, primerlerin kalıp DNA üzerindeki komplementer dizilerine bağlanması sağlanmaktadır (Şekil 10.1). Bu aşama da bağlanma-annealing aşaması olarak isimlendirilmektedir.

Isıya dirençli polimeraz enzimi primerlerin 3’ ucundan başlayarak yeni bir DNA sentezlemektedir (Şekil 10.2). Bu aşamaya uzama (elongation) adı verilmektedir.

Tampon: Asit ve bazların bir araya gelerek oluşturdukları tuzdan oluşan, pH değişmesine direnç gösteren özel pH değerine sahip bir sistem veya çözelti, buffer.

Polimerizasyon: Küçük moleküllerin birleşerek, genellikle büyük molekül ağırlıkta bir bileşik oluşturması işlemi

PCR’ın ilk aşamasında kalıp DNA’nın birkaç dakika süresince 90 °C’nin üzerinde tutularak zincirlerin birbirinden ayrılması gerekmektedir. Bu işlem karşılıklı zincirler arasındaki hidrojen bağlarının kırılmasını sağlamaktadır ve denatürasyon adı verilmektedir.